转录组入门(2)：读文章拿到测序数据，转录测序

转录组入门(2)：读文章拿到测序数据，转录测序

https://trace.ncbi.nlm.nih.gov/Traces/study/?acc=PRJNA323422

lne是perl的参数，效果是： perl接收你的键盘输入（用后面的代码）处理后，输出一个换行，然后等待接收下一个输入

perl -lne '$id=substr($_,0,6);print "axel ftp://ftp-trace.ncbi.nih.gov/sra/sra-instant/reads/ByRun/sra/SRR/$id/$_/$_.sra"' SRR_Acc_List.txt > sra_down.sh
bash sra_down.sh
ls *.sra|while read id;do(fastq-dump --split-3 $id);done
chmod u-w *