Linux下R语言环境搭建


R是用于统计分析、绘图的语言和操作环境。R是属于GNU系统的一个自由、免费、源代码开放的软件，他是一个用于统计计算和统计制图的优秀工具。

环境搭建：

1.安装proj

 

[root@uvmsvr12 gis]#wget http://download.osgeo.org/proj/proj-4.9.1.tar.gz
[root@uvmsvr12 gis]# tar -zxvf proj-4.9.1.tar.gz
[root@uvmsvr12 proj-4.9.1]# cd proj-4.9.1
[root@uvmsvr12 proj-4.9.1]# ./configure
[root@uvmsvr12 proj-4.9.1]# make && make install

安装完成后会在/usr/local/include下生成.h文件（org_proj4_Projections.h,proj_api.h,projects.h），并在/usr/local/lib文件夹下生成库文件。

 

将/usr/local/lib添加到环境变量中：

 

[root@uvmsvr12 proj-4.9.1]# vim /etc//ld.so.conf.d/local.conf
/usr/local/lib
[root@uvmsvr12 proj-4.9.1]#ldconfig -v

 

2.安装GEOS

 

[root@uvmsvr12 gis]# wget http://download.osgeo.org/geos/geos-3.4.2.tar.bz2
[root@uvmsvr12 gis]# tar -jxvf geos-3.4.2.tar.bz2
[root@uvmsvr12 gis]# cd geos-3.4.2
[root@uvmsvr12 gis]# make && make install

 

3.安装gdal

 

[root@uvmsvr12 gis]#wget http://download.osgeo.org/gdal/CURRENT/gdal-1.11.2.tar.gz
[root@uvmsvr12 gis]# tar -zxvf gdal-1.11.2.tar.gz
[root@uvmsvr12 gis]# cd gdal-1.11.2
[root@uvmsvr12 gis]# ./configure --with-geos=/usr/local/bin/geos-config
[root@uvmsvr12 gis]# make && make install

注意：

 

在./configure检测配置信息会显示相关组件的是否支持，其中显示“GEOS support:no”则说明不支持geos，我们需要加上参数--with-geos=/usr/local/bin/geos-config。

4.安装R语言

(1)先安装java环境，如：

 

##JAVA###
export JAVA_HOME=/usr/local/jdkXXX
export JRE_HOME=/usr/local/jdkXXX/jre
export PATH=$JAVA_HOME/bin:$PATH
export CLASSPATH=.:$JAVA_HOME/lib/dt.jar:$JAVA_HOME/lib/tools.jar

 

不要忘记source /etc/profile,载入环境变量。

(2)安装R语言

 

[root@uvmsvr12 gis]# yum install gcc-gfortran readline-devel libXt-devel
[root@uvmsvr12 gis]# wget http://mirror.bjtu.edu.cn/cran/src/base/R-3/R-3.2.0.tar.gz
[root@uvmsvr12 gis]# tar -zxvf R-3.2.0.tar.gz
[root@uvmsvr12 gis]# cd R-3.2.0
[root@uvmsvr12 gis]# ./configure  --enable-R-shlib  --prefix=/usr/local/R-3.2.0
[root@uvmsvr12 gis]# make && make install
注意：

 

若报错“configure: error: No F77 compiler found”，则需要yum install gcc-gfortran

若报错"configure: error: --with-readline=yes (default) and headers/libs are not available ,configure: error: –with-x=yes (default) and X11 headers/libs are not available"，需要yum install readline-devel libXt-devel。

若你的R环境tab自动补全以及上下左右等方向键都无法使用，也需要安装yum install readline-devel libXt-devel。

最后将你的R语言执行命令加入环境变量,这样就直接可以通过输入R进入了。

export PATH=/usr/local/R-3.2.0/bin:$PATH

另，通过R安装包

 

[root@usvr-115 gis]# R

R version 3.2.0 (2015-04-16) -- "Full of Ingredients"
Copyright (C) 2015 The R Foundation for Statistical Computing
Platform: x86_64-unknown-linux-gnu (64-bit)

R是自由软件，不带任何担保。
在某些条件下你可以将其自由散布。
用'license()'或'licence()'来看散布的详细条件。

R是个合作计划，有许多人为之做出了贡献.
用'contributors()'来看合作者的详细情况
用'citation()'会告诉你如何在出版物中正确地引用R或R程序包。

用'demo()'来看一些示范程序，用'help()'来阅读在线帮助文件，或
用'help.start()'通过HTML浏览器来看帮助文件。
用'q()'退出R.

> install.packages('rjson')
检测包是否安装require(rjson)

 

若在安装包过程中出现“geos-config not found ”或"gdal-config not found",而我们的geos-config，gdal-config已经安装在/usr/local/bin下，我们需要将/usr/local/bin加入环境变量。

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