Ubuntu 10.10中安装GAMIT 10.40

Ubuntu 10.10中安装GAMIT 10.40

主要的安装过程

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Ubuntu 10.10中

【1】Ubuntu系统的初步配置。

打开终端，具体方式是applications-->accessories-->terminal。

运行 :

sudo apt-get install gfortran

sudo apt-get install build-essential

sudo apt-get install libx11 -dev

sudo apt-get install csh

sudo apt-get install tcsh

sudo apt-get install gmt

【2】安装GAMIT。

在terminal中

运行：

cd  /opt/Gamit                              进入/opt/GamitGlobk目录

chmod +x install_software            执行install_software安装脚本，给予该文件可执行属性

./install_software

【3】设置环境变量和命令路径

在terminal中

运行：

echo $SHELL                            查看当前的shell

如果是/bin/bash

则

在系统的 etc 目录下，有一个 profile 文件，编辑该文件：

$gedit /etc/profile

在最后边加入需要设置变量的shell语句

PATH="$PATH:/opt/Gamit/gamit/bin:/opt/Gamit/com:/opt/Gamit/kf/bin"

HELP_DIR=/opt/Gamit/help/

export PATH HELP_DIR该文件编辑保存后，重启系统，变量生效。

如果想要在csh环境下，则在终端输入

tcsh

再输入/bin/csh

重启，则系统改为csh环境。

接着，在cshrc文件中加入

PATH="$PATH:/opt/Gamit/gamit/bin:/opt/Gamit/com:/opt/Gamit/kf/bin"

HELP_DIR=/opt/Gamit/help/

export PATH HELP_DIR

该文件编辑保存后，重启系统，变量生效。

【4】验证

在terminal中

运行：

doy

如果有显示日期等，安装基本成功。

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遇到的问题

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【1】HELP_DIR=/opt/Gamit/help/  因为对文件夹不熟悉，我写的是“HELP_DIR=/opt/Gamit/help”，

结果一直遇到错误如下

**ERROR** Opening help file.

 Check that enviroment variable HELP_DIR points to directory with help files.

IOSTAT error 2 occurred openingdoy.hlp in doy

WARNING:110228:2352:38.0 DOY/doy: IOSTAT error opening file doy.hlp ERROR 2

很久才检查出这个错误。

【2】因为是在虚拟机中安装的Ubuntu和gamit，所以必须保证有足够的内存。

因为内存分配不足，之前安装过两次，都一直出现错误的情况。这样的问题是第二次了，只要看到Killed字样，就要考虑系统内存分配问题。

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一些常用命令行语句

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source /etc/csh.cshrc 保存修改? 这一句一直出现错误提示“syntax error near unexpected token'('” ，不知道为何？

sudo apt-get install rar unrar p7zip  %rar文件压缩解压缩

参考文献