Linux安装R语言包(Installing R packages on Linux)

Linux安装R语言包(Installing R packages on Linux)

R的包（package）通常有两种：
1 binary package：这种包属于即得即用型（ready-to-use），但是依赖与平台，即Win和Linux平台下不同。
2 Source package: 此类包可以跨平台使用，但用之前需要处理或者编译（compiled）。

.libPaths()：查看包的安装目录
library()：查看已经安装的包目录
library(mypackage)：载入mypackage包
help(package = 'mypackage')：查看‘mypackage’的帮助
vignette('mypackage')：有的包，特别是bioconductor的包有vignette，用函数查看

安装source package方法

1 在终端输入 # R CMD INSTALL /.../mypackage.tar.gz
使用此方法，需要解决包依赖问题，即安装此包所依赖的包，安装过程有提示

2 也可以使用R的install.packages()函数安装（没有尝试安装）

需要更新：如何更新包、从insall.packages()安装、如何卸载包、安装binary和source package的区别与联系