CentOS 6.4上搭建MPICH2开发环境的步骤
CentOS 6.4上搭建MPICH2开发环境的步骤
前提条件：
共有5台机器，均安装有CentOS6.4系统，主机名分别为node0，node1， node2， node3， node4。node0作为主节点，这里的主节点是指将node0作为NFS的服务器端。
MPICH2的安装包：mpich2-1.2.1p1.tar.gz，可以从MPICH的官网下载
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MPICH2-1.3中的hydra配置与使用
Ubuntu 11.10下面配置MPICH2完全手册
Ubuntu 8.10上安装MPICH2并行计算环境
RedHat 5.4安装MPICH2-1.4.1p1全过程
MPICH2的Linux下安装及其实现多台主机高性能计算
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以下操作均使用root用户名
1. 配置5台机器的网络，详细配置过程见我的另一篇文章《CentOS静态IP的网路配置方法》
2. 为5台机器创建统一的用户名cluster和相同的密码：
useradd cluster
passwd cluster
修改/etc/sudoers文件，添加如下一行，使cluster具有临时root权限的能力：
cluster ALL=(ALL) ALL
以下操作均使用cluster用户名
3. 配置SSH，使任何两台机器之间均可无需密码而直接互相登录，详细配置过程见我的另一篇文章《两台主机可以无需密码而直接互相登录的SSH配置方法》
4. 配置NFS，node0作为服务器端，其他4台机器作为客户端，所有机器的共享目录均为/home/cluster/mirror，详细配置过程见我的另一篇文章《CentOS下NFS的安装过程》
5. 在node0上安装MPICH2开发环境
首先确认系统中安装有gcc、g++、make和python这些编译工具
创建MPICH2的安装目录：
mkdir /home/cluster/mirror/mpich2
将mpich2-1.2.1p1.tar.gz上传到/home/cluster/mirror，并解压缩：
tar -zxv -f mpich2-1.2.1p1.tar.gz
在/home/cluster/mirror/ mpich2-1.2.1p1目录中执行如下命令：
./configure --prefix=/home/cluster/mirror/mpich2
make
make install
创建/home/cluster/mpd.hosts文件，文件内容如下：
node0
node1
node2
node3
node4
6. 在5台机器上配置环境变量
在/home/cluster/.bashrc文件中加入：
export PATH=$PATH:/home/cluster/mirror/mpich2/bin
export LD_LIBRARY_PATH=$LD_LIBRARY_PATH:/home/cluster/mirror/mpich2/lib
使配置文件生效：
source /home/cluster/.bashrc
测试MPICH2是否安装成功：
which mpd
which mpiexec
创建/home/cluster/.mpd.conf文件，文件内容如下（””中的内容为任意字符串，但是所有机器都要一样）：
secretword="lab311"
修改.mpd.conf文件的权限，使得只有用户cluster具有读写该文件的权限：
chmod 600 /home/cluster/.mpd.conf
测试各台机器能否启动mpd管理器，正常情况下mpdtrace的执行结果为本机的主机名，注意测试完毕后一定要用mpdallexit命令关闭mpd，否则后面启动集群时会出现连接失败的错误：
mpd &
mpdtrace
mpdallexit
7. 在node0测试整个集群
启动集群前需要将所有机器的防火墙关闭：
sudo service iptables stop
sudo chkconfig iptables off
启动集群（参数-n 5表示启动5台机器）：
mpdboot -n 5 -f /home/cluster/mpd.hosts
查看已经启动的机器：
mpdtrace
正常情况下会显示如下结果：
node0
node1
node2
node3
node4
关闭集群：
mpdallexit
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