Spark SQL 源码分析之 In-Memory Columnar Storage 之 in-memory query,in-memorycolumnar


    /** Spark SQL源码分析系列文章*/

    前面讲到了Spark SQL In-Memory Columnar Storage的存储结构是基于列存储的。

    那么基于以上存储结构,我们查询cache在jvm内的数据又是如何查询的,本文将揭示查询In-Memory Data的方式。

一、引子

本例使用hive console里查询cache后的src表。 select value from src

当我们将src表cache到了内存后,再次查询src,可以通过analyzed执行计划来观察内部调用。

即parse后,会形成InMemoryRelation结点,最后执行物理计划时,会调用InMemoryColumnarTableScan这个结点的方法。

如下:

scala> val exe = executePlan(sql("select value from src").queryExecution.analyzed)
14/09/26 10:30:26 INFO parse.ParseDriver: Parsing command: select value from src
14/09/26 10:30:26 INFO parse.ParseDriver: Parse Completed
exe: org.apache.spark.sql.hive.test.TestHive.QueryExecution = 
== Parsed Logical Plan ==
Project [value#5]
 InMemoryRelation [key#4,value#5], false, 1000, (HiveTableScan [key#4,value#5], (MetastoreRelation default, src, None), None)

== Analyzed Logical Plan ==
Project [value#5]
 InMemoryRelation [key#4,value#5], false, 1000, (HiveTableScan [key#4,value#5], (MetastoreRelation default, src, None), None)

== Optimized Logical Plan ==
Project [value#5]
 InMemoryRelation [key#4,value#5], false, 1000, (HiveTableScan [key#4,value#5], (MetastoreRelation default, src, None), None)

== Physical Plan ==
InMemoryColumnarTableScan [value#5], (InMemoryRelation [key#4,value#5], false, 1000, (HiveTableScan [key#4,value#5], (MetastoreRelation default, src, None), None)) //查询内存中表的入口

Code Generation: false
== RDD ==

二、InMemoryColumnarTableScan

InMemoryColumnarTableScan是Catalyst里的一个叶子结点,包含了要查询的attributes,和InMemoryRelation(封装了我们缓存的In-Columnar Storage数据结构)。
执行叶子节点,出发execute方法对内存数据进行查询。 1、查询时,调用InMemoryRelation,对其封装的内存数据结构的每个分区进行操作。 2、获取要请求的attributes,如上,查询请求的是src表的value属性。 3、根据目的查询表达式,来获取在对应存储结构中,请求列的index索引。 4、通过ColumnAccessor来对每个buffer进行访问,获取对应查询数据,并封装为Row对象返回。

private[sql] case class InMemoryColumnarTableScan(
    attributes: Seq[Attribute],
    relation: InMemoryRelation)
  extends LeafNode {


  override def output: Seq[Attribute] = attributes


  override def execute() = {
    relation.cachedColumnBuffers.mapPartitions { iterator =>
      // Find the ordinals of the requested columns.  If none are requested, use the first.
      val requestedColumns = if (attributes.isEmpty) {
        Seq(0)
      } else {
        attributes.map(a => relation.output.indexWhere(_.exprId == a.exprId)) //根据表达式exprId找出对应列的ByteBuffer的索引
      }


      iterator
        .map(batch => requestedColumns.map(batch(_)).map(ColumnAccessor(_)))//根据索引取得对应请求列的ByteBuffer,并封装为ColumnAccessor。
        .flatMap { columnAccessors =>
          val nextRow = new GenericMutableRow(columnAccessors.length) //Row的长度
          new Iterator[Row] {
            override def next() = {
              var i = 0
              while (i < nextRow.length) {
                columnAccessors(i).extractTo(nextRow, i) //根据对应index和长度,从byterbuffer里取得值,封装到row里
                i += 1
              }
              nextRow
            }


            override def hasNext = columnAccessors.head.hasNext
          }
        }
    }
  }
}

查询请求的列,如下:

scala> exe.optimizedPlan
res93: org.apache.spark.sql.catalyst.plans.logical.LogicalPlan = 
Project [value#5]
 InMemoryRelation [key#4,value#5], false, 1000, (HiveTableScan [key#4,value#5], (MetastoreRelation default, src, None), None)


scala> val relation =  exe.optimizedPlan(1)
relation: org.apache.spark.sql.catalyst.plans.logical.LogicalPlan = 
InMemoryRelation [key#4,value#5], false, 1000, (HiveTableScan [key#4,value#5], (MetastoreRelation default, src, None), None)


scala> val request_relation = exe.executedPlan
request_relation: org.apache.spark.sql.execution.SparkPlan = 
InMemoryColumnarTableScan [value#5], (InMemoryRelation [key#4,value#5], false, 1000, (HiveTableScan [key#4,value#5], (MetastoreRelation default, src, None), None))


scala> request_relation.output //请求的列,我们请求的只有value列
res95: Seq[org.apache.spark.sql.catalyst.expressions.Attribute] = ArrayBuffer(value#5)

scala> relation.output //默认保存在relation中的所有列
res96: Seq[org.apache.spark.sql.catalyst.expressions.Attribute] = ArrayBuffer(key#4, value#5)


scala> val attributes = request_relation.output 
attributes: Seq[org.apache.spark.sql.catalyst.expressions.Attribute] = ArrayBuffer(value#5)


整个流程很简洁,关键步骤是第三步。根据ExprId来查找到,请求列的索引 attributes.map(a => relation.output.indexWhere(_.exprId == a.exprId))
//根据exprId找出对应ID
scala> val attr_index = attributes.map(a => relation.output.indexWhere(_.exprId == a.exprId))
attr_index: Seq[Int] = ArrayBuffer(1) //找到请求的列value的索引是1, 我们查询就从Index为1的bytebuffer中,请求数据

scala> relation.output.foreach(e=>println(e.exprId))
ExprId(4)    //对应<span style="font-family: Arial, Helvetica, sans-serif;">[key#4,value#5]</span>
ExprId(5)

scala> request_relation.output.foreach(e=>println(e.exprId))
ExprId(5)

三、ColumnAccessor

ColumnAccessor对应每一种类型,类图如下:


最后返回一个新的迭代器:

          new Iterator[Row] {
            override def next() = {
              var i = 0
              while (i < nextRow.length) { //请求列的长度
                columnAccessors(i).extractTo(nextRow, i)//调用columnType.setField(row, ordinal, extractSingle(buffer))解析buffer
                i += 1
              }
              nextRow//返回解析后的row
            }

            override def hasNext = columnAccessors.head.hasNext
          }

四、总结

    Spark SQL In-Memory Columnar Storage的查询相对来说还是比较简单的,其查询思想主要和存储的数据结构有关。

    即存储时,按每列放到一个bytebuffer,形成一个bytebuffer数组。

    查询时,根据请求列的exprId查找到上述数组的索引,然后使用ColumnAccessor对buffer中字段进行解析,最后封装为Row对象,返回。

——EOF——

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可以介绍下 oracle database 12c数据库的 In-Memory Option特性,

12c中提出了In-Memory Option,虽然在12.1.0.1中还未引入该特性,12c in-memory database cache的灵魂是 in memory in compressed columnar 简称IMCC ,在数据库中所有启用了IMCC 的表 将被加载在 in-memory snapshot store. 中。这个 in-memory snapshot store要通过 transaction journal 来更新。

该In-Memory Option特性致力于使用内存中的列存处理来实现以下4个主要目标:
显著增快SQL的全表扫描处理速度, 全表扫描将增快10~100倍,基于CPU的最大数据处理速度,对于简单扫描可以每秒扫描10亿行数据; 对于简单的连接过滤谓词最终选出少量数据行的达到每秒1亿条每秒。 与今日ORACLE数据库中对于内存在的大表访问最多处理2000万行每秒对比,将有巨大的进步。对于长向量CPU处理和压缩 积极使用有效内存
显著增快复杂SQL的处理,在绝大多数场景中连接处理将变快10倍或者更多。聚集,排序,分组也将随之变快。 积极使用内存、物化的连接键合以及压缩将使用in-memory算法大大得益,比之将临时数据溢出到磁盘的效益多出不可以道里计。
显著增快事务处理,DML操作-单行DML和批量DML都将运行地更快; 单行的处理收益主要来源于降低10倍的索引维护。
100%的应用程序透明。类似于OLTP压缩,主要的优势在于对于应用而言完全透明。所有的其他ORACLE特性均将可以与in-memory option一起工作,包括partitioning, indexes, text indexes,而没有明确的数据类型或者存储类型限制。
 


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