Linux CentOS下安装MPICH以及运行第一个并行程序


一：Linux下安装与配置MPICH

为了在Linux下运行我们的并行程序，我们需要安装MPICH，现在的版本是MPICH2，下载地址：mpich2-1.5.tar.gz  [文件大小：21.77 MB] 下载： 

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在 2012年LinuxIDC.com\10月\Linux CentOS下安装MPICH以及运行第一个并行程序

下载方法见 http://www.bkjia.net/thread-1187-1-1.html

下载完成后，用SSH登录Linux系统，在这里我用的root的登录身份。在/home 下创建一个目录，用来表示某个用户的文件 mkdir  houqingdong  ， 将tar.gz(注意，这里是tar.gz后缀的压缩文件，不一样的压缩文件在Linux下解压缩时所用的命令也不一样)，还要注意一点，就是解压缩文件的过程一定要在Linux系统下完成，（起初的时候我是在Windows下解压完成的，将解压完成后的文件夹直接上传到Linux下，在安装执行./configure时会出现错误！！）。

现在我们解压缩文件：tar -zxv -f mpich2-1.5.tar.gz(这里是你自己的压缩文件) ,然后会出现具体的解压缩过程，解压完毕后，在/home 下会出现mpich2-1.5这个文件夹

进入该文件夹：cd mpich2-1.5  ，进入之后，接下来我们要做的工作就是要配置它的安装目录，在这之前我们先在houqingdong文件夹下创建我们存放MPICH程序的文件夹，假如该文件夹为mpiexe :  cd /home/houqingdong    mkdir  mpiexe  ，创建完成后，就执行  ./configure -prefix=/home/houqingdong/mpiexe  就是配置我们的安装目录，这里同样会等待一段时间，等成功执行后，在mpich2-1.5下会生成mkfile文件，这里我们执行的时候有时会出现这样的提示：-bash: ./configure: Permission denied 这句话是提醒我们权限不够，仔细看一下会发现configure没有x(执行)权限，这里我们要执行： chmod +x ./configure 即可，这句指令的意思是为configure增加x的权限

再一次执行：./configure -prefix=/home/houqingdong/mpiexe  同样会等一段时间，最终执行完后不会报错，才能继续向下执行，如果发生某些错误，请参考：

上一步执行完我们接着执行： mkfile

执行完mkfile， 然后开始实际的安装 执行  mkfile install，就会看到程序正在安装，安装完成后进入/home/houqingdong/mpiexe可以看到多出了很多像bin  include  lib样的文件。

先在将我的第一个并行文件上传到/home/houqingdong/目录下：

程序为：

  1. #include "mpi.h" 
  2. #include <stdio.h> 
  3.  
  4. int main (int argc, char *argv[]) { 
  5.    int i; 
  6.    int id;               /* Process rank */ 
  7.    int p;                /* Number of processes */ 
  8.    void check_circuit (int, int); 
  9.  
  10.    MPI_Init (&argc, &argv); 
  11.    MPI_Comm_rank (MPI_COMM_WORLD, &id); 
  12.    MPI_Comm_size (MPI_COMM_WORLD, &p); 
  13.  
  14.    for (i = id; i < 65536; i += p) 
  15.       check_circuit (id, i); 
  16.  
  17.    printf ("Process %d is done\n", id); 
  18.    fflush (stdout); 
  19.    MPI_Finalize(); 
  20.    return 0; 
  21. } 
  22.  
  23.  
  24. /* Return 1 if 'i'th bit of 'n' is 1; 0 otherwise */ 
  25. #define EXTRACT_BIT(n,i) ((n&(1<<i))?1:0) 
  26.  
  27. void check_circuit (int id, int z) { 
  28.    int v[16];        /* Each element is a bit of z */ 
  29.    int i; 
  30.  
  31.    for (i = 0; i < 16; i++) v[i] = EXTRACT_BIT(z,i); 
  32.    if ((v[0] || v[1]) && (!v[1] || !v[3]) && (v[2] || v[3]) 
  33.       && (!v[3] || !v[4]) && (v[4] || !v[5]) 
  34.       && (v[5] || !v[6]) && (v[5] || v[6]) 
  35.       && (v[6] || !v[15]) && (v[7] || !v[8]) 
  36.       && (!v[7] || !v[13]) && (v[8] || v[9]) 
  37.       && (v[8] || !v[9]) && (!v[9] || !v[10]) 
  38.       && (v[9] || v[11]) && (v[10] || v[11]) 
  39.       && (v[12] || v[13]) && (v[13] || !v[14]) 
  40.       && (v[14] || v[15])) { 
  41.       printf ("%d) %d%d%d%d%d%d%d%d%d%d%d%d%d%d%d%d\n", id, 
  42.          v[0],v[1],v[2],v[3],v[4],v[5],v[6],v[7],v[8],v[9], 
  43.          v[10],v[11],v[12],v[13],v[14],v[15]); 
  44.       fflush (stdout); 
  45.    } 
  46. } 

如果我们现在想编译文件： 在/home/houqingdong下执行：  mpicc -o hello  hello.c  这时候会提醒：-bash:mpicc  command not found 这是因为我们还没有配置路径

在命令行下输入： export PATH=/home/houqingdong/mpiexe/bin:$PATH  注意：这里仅仅是暂时的设置路径，在重启后效果会消失，如果想一劳永逸的配置，请google查询

看一下我们配置是否成功可以执行一下  echo $PATH 看一下输出结果中是否有我们的路径

我们再来编译一次： mpicc -o hello hello.c

然后在/home/houqingdong 目录下会生成一个hello的可执行文件，然后运行 mpirun -n 2 ./hello 即可看到输出结果，这里我们采用2个处理器来执行。

输出结果为：

嘿嘿 。。。 大功告成！！！！

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